Ingresó en el Partido Comunista como varios miembros de su familia y de la de su esposa. Desde el comienzo de la guerra, en julio de 1936, se une a la 3ª Compañía del Batallón 103 del Ejército Republicano, que operaba en el norte de Madrid. Más tarde forma parte de las tropas españolas implicadas en la defensa de Barcelona, después pasa la frontera francesa con su primo Marcial el 14 de enero de 1939. Ignora todo sobre lo que les ha sucedido a su esposa y a sus hijos. Comienza para él un doloroso exilio. Lo encierran en un campo de concentración al aire libre en febrero de 1939 en las playas de Argelès-sur-Mer (Pirineos Orientales), en donde los refugiados están estrechamente vigilados por militares franceses; después es encerrado en Septfonds (Tarn y Garonne) y en el campo de concentración de Vernet-sur-Ariège, en el norte de Pamiers (Ariège). El gobierno francés autoriza a los refugiados españoles a dejar los campos de concentración si firman un contrato de trabajo. Muchos de ellos son contratados como obreros agrícolas. Éste es el caso de Tomás Pereira, que encuentra un empleo en el Loiret, en la granja del Château du Buisson, situada en la comuna de Saint-Geneviève-des-Bois. Es alojado en Nogent-sur-Vernisson (Loiret), en el Hotel de la Montaña, cerca de su lugar de trabajo.
En julio de 1944, las tropas de ocupación, principalmente el Regimiento de Seguridad 1010, rastrean los macizos boscosos situados al norte de Gien (Loiret). Los alemanes van en busca de resistentes que se hayan instalado en la zona de Les Choux y Boismorand. Un informe policial hecho después de la liberación proporciona los siguientes datos: “El 29 de julio de 1944, el llamado Tomás Pereira recibió la visita de un hombre que le preguntó si conocía a los hermanos Letourneau, domiciliados en Boismorand. A su respuesta afirmativa, este hombre le pidió que fuera a su casa con el fin de prevenirles de que los alemanes procederían a arrestar gente y que, probablemente, se presentarían en Boismorand”.
Tomás Pereira salió entonces en bicicleta para Boismorand, situado a unos diez kilómetros de Nogent-sur-Vernisson, pero cuando llegó allí ya habían llegado los alemanes, arrestando a tres hombres alojados en el café-tienda que habían sido previamente denunciados: el propietario Georges Letourneau, su hermano Edgar y su primo Louis Jonard (muerto en Buchenwald), todos ellos miembros de la Resistencia. Tomás Pereira fue igualmente arrestado e internado en Orleans hasta el 10 de agosto como preso político. Lo llevaron a Fresnes (Seine) y desde allí le subieron al último tren que salió de París, estación de Pantin, el 15 de agosto de 1944. En compañía de más de 2.250 hombres y mujeres, emplea cuatro días para llegar a Buchenwald, donde Tomás Pereira queda inscrito con el número 77255.
A partir del 3 de septiembre fue trasladado a Dora y cuatro días más tarde a Ellrich, que se convirtió en Mittelbau II en noviembre de 1944. Tomás logra sobrevivir en el “infierno de Ellrich”. Le asignan la terrible excavación de las galerías que le quema los pulmones. Evacuado por el convoy ferroviario del 5 de abril de 1945 que llegó a Bergen-Belsen el día 11, fue liberado cuatro días más tarde por los británicos, que descubrieron 60.000 deportados esqueléticos deambulando entre montones de cadáveres. En su expediente médico se indica “mal estado general”. Efectivamente, pesa 32 kilos, ha perdido algunos dientes y tiene problemas pulmonares. Llegó el 4 de mayo de 1945 al centro de repatriación de Lille, donde estuvo varios meses para recuperarse.
De regreso a Orleans, a casa de su primo Marcial, trabaja como albañil y se reencuentra con su mujer. Ella también había sido encarcelada en la prisión de Ventas de Madrid con su propia madre. Tres de sus hermanos, Mauricio, Sixto y Félix, habían sido fusilados. María salió de la cárcel en 1945. Tomás nunca dejó de buscarla y consiguió que viajara clandestinamente a Francia. Llegó, sola, en enero de 1951. Los dos niños, Marcelino y María, se quedaron en San Sebastián de los Reyes. La pareja vivió en Orleans, en el número 6 de la rue de l'Université. Una niña, Olga, nació en 1953. Marcelino y María se unieron a sus padres un poco más tarde.
Tomás Pereira conservó su nacionalidad española y obtuvo un permiso de residencia de residente privilegiado en Francia. Ante la negativa del gobierno español de facilitarles el pasaporte, Tomás y María tomaron la nacionalidad francesa en 1970, para facilitar la integración de sus hijos en la sociedad francesa. Gracias a ello pudieron así viajar regularmente a España.
Las secuelas de la deportación que sufrió estuvieron siempre muy presentes. Tomás tuvo que cesar toda actividad laboral en 1962 por problemas de salud: tuberculosis, silicosis, insuficiencia cardiaca... Murió el 30 de mayo de 1983 en Orleans tras una larga estancia en un sanatorio francés. Las cenizas de ambos fueron enterradas en una sepultura familiar en el cementerio de San Sebastián de los Reyes.
El nombre de Tomás está junto al de los 549 madrileños que estuvieron en campos de concentración y de exterminio nazis en el monumento que se encuentra en la calle del Rollo (detrás de la Casa de Cisneros) de Madrid capital, realizado por el poeta y escultor José Miguel Utande, vecino de San Sebastián de los Reyes.
